L'étude du Cnr-Ibiom de Bari publiée dans Communications Biology permet de comprendre le degré d'infectiosité d'une personne touchée par le Covid-19
Il existe une méthodologie qui permet de vérifier le degré d'infectiosité d'une personne touchée par le Covid-19, en discriminant entre le génome à ARN du virus et les molécules issues de sa transcription. Ceci est soutenu par les recherches menées par le Cnr-Ibiom de Bari en collaboration avec l'Université de Bari et l'Université d'État de Milan, avec le soutien de la plate-forme bioinformatique et génomique d'Elixir Italia.
J'ÉTUDIE
L'étude a été réalisée sur 166 sujets touchés par le Covid-19 avec différents degrés de charge virale dans laquelle une méthodologie a été développée pour déterminer le nombre absolu de molécules d'ARN viral contenues dans les écouvillons moléculaires utilisés pour identifier la positivité au virus.
QUE SE PASSE-T-IL APRÈS L'INFECTION
Comme l'indique l'étude, suite à l'infection par le SRAS-Cov-2, le virus produit deux types de molécules d'ARN :
1) un brin d'ARN d'environ 30 000 nucléotides correspondant au génome complet du virus ;
2) une série de molécules d'ARN discontinues également appelées transcrits sous-génomiques qui codent pour les protéines nécessaires à l'assemblage de nouveaux virions et sont nécessaires à la réplication du virus. Ces molécules constituent donc un indice de l'activité de réplication virale et, indirectement, du degré d'infectiosité d'un sujet atteint par le Covid-19.
PCR NUMÉRIQUE GOUTTELETTES
« La nouvelle méthodologie développée, basée sur l'utilisation de la technique 'droplet digital PCR' (ddPCR), permet de compter séparément le nombre de molécules d'ARN génomiques et subgénomiques. Les tests moléculaires standards actuellement utilisés, basés sur la technique de 'PCR en temps réel', ne sont pas capables de discriminer entre les deux types d'ARN viral », a expliqué Graziano Pesole du Cnr-Ibiom.
DÉTERMINER LE DEGRÉ D'INFECTIVITÉ
Les molécules subgénomiques étant des marqueurs d'un processus infectieux en cours, dans lequel de nouvelles particules virales prolifèrent, des approches basées sur ce principe pourront être appliquées à l'avenir pour déterminer le degré d'infectiosité d'une personne, même dans le temps.
« L'étude a montré que le pourcentage d'ARN subgénomiques est lié à la charge virale et peut également être déterminé de la même manière par analyse de séquençage de masse du transcriptome. Les résultats présentés contribuent à une meilleure compréhension de la dynamique d'expression du SRAS-Cov-2 dans différentes conditions et à développer des stratégies de diagnostic innovantes pour faire face à la pandémie », a conclu Pesole.
Cet article est une traduction automatique de la langue italienne d’un article publié sur le magazine Début Magazine à l’URL https://www.startmag.it/sanita/quanto-sei-contagioso-capire-la-carica-virale-di-un-positivo-al-covid-19-secondo-il-cnr/ le Tue, 05 Oct 2021 13:04:04 +0000.